Более 40 лет АО «Научно-исследовательский институт систем автоматизации» ведет разработки в области автоматизированных информационных систем обработки информации и управления. Все виды деятельности предприятия обеспечены лицензиями, в том числе на право выполнения работ, составляющих государственную тайну. АО "НИИСА" осуществляет научные исследования, опытно-конструкторские, проектные и технологические разработки, производство, внедрение и эксплуатацию систем, комплексов и изделий государственного и коммерческого назначения в следующих областях:
- системы и средства связи и управления связью;
- автоматизированные системы освещения и контроля безопасности государственных границ,
- автоматизация уголовно-процессуальной деятельности правоохранительных органов;
- системы и средства контроля и защиты информации;
- портовые системы управления движением судов
- средства контроля и управления объектами городского снабжения.
Основной разработкой АО «НИИСА» являются СИСТЕМЫ: Комплексного отображения морской обстановки, Управления движением судов порту, навигационной безопасности и передачи данных.